Le Nouveau Praticien Vétérinaire Canine & féline 2024;21(90):5

Le microbiote, un continent encore largement méconnu

Juan HernandezDMV, PhD, dipl. ACVIM, dipl. ECVIM médecine interne

Longtemps réduit au simple rôle de « flore intestinale », le microbiote est aujourd’hui reconnu comme un véritable organe fonctionnel, au carrefour de la santé digestive, immunitaire, métabolique et désormais comportementale de nos animaux. Ce dossier thématique du Nouveau Praticien Vétérinaire canine & féline, propose d’explorer ce bouleversement scientifique, à la croisée de la clinique et de la recherche.

Les avancées récentes dessinent une médecine vétérinaire en pleine mutation. Intégrer le microbiote à notre raisonnement clinique n’est plus une option, mais une nécessité. Pour autant, il ne s’agit pas de substituer une approche à une autre, ni de rejeter les fondements de la médecine fondée sur les preuves, mais bien d’élargir notre champ d’analyse. L’enjeu est désormais d’enrichir notre démarche clinique en y intégrant les données issues des sciences du microbiote, avec la même rigueur scientifique et le même souci de validation que pour toute stratégie thérapeutique.

Mais cette dynamique, aussi stimulante soit-elle, appelle à la lucidité. Il serait illusoire de penser que nous maîtrisons déjà les subtilités d’un écosystème aussi dense, mouvant et interconnecté. Le microbiote demeure un continent largement inexploré. Le risque serait de céder à l’effet de mode, de chercher à tout prix des réponses immédiates à des questions encore mal posées. La prudence, la rigueur méthodologique et le temps long de la recherche sont plus que jamais nécessaires pour éviter les simplifications abusives.

Dans cette optique, ce dossier thématique propose un parcours structuré à travers les principales applications cliniques du microbiote en médecine vétérinaire. Il s’ouvre par une synthèse globale sur les rôles systémiques du microbiote, véritable organe à part entière, puis se penche sur ses perturbations lors de maladies digestives. Plusieurs stratégies de modulation sont ensuite abordées : l’alimentation fonctionnelle, l’utilisation raisonnée des probiotiques, ainsi que le repositionnement critique du métronidazole en gastro-entérologie canine. Enfin, les deux derniers articles sont consacrés à la transplantation de microbiote fécal (TMF), l’un en présentant les principes et les données actuelles, l’autre sous forme de fiche technique permettant aux cliniciens de la mettre en œuvre.

Intégrer le microbiote à notre raisonnement clinique n’est plus une option, mais une nécessité.

À Nantes, nous avons souhaité être non seulement utilisateurs, mais aussi acteurs du développement de la TMF, en concevant des gélules gastro-résistantes dans un souci de rigueur, de sécurité, et de reproductibilité. Ce travail de terrain illustre bien notre ambition collective : produire, valider, et diffuser les connaissances avec exigence scientifique et sens clinique.

Ce dossier se veut ainsi, à la fois, un reflet de l’état de l’art – à la pointe des connaissances actuelles – et une invitation à la nuance. À travers la diversité des contributions réunies, il offre des clés de compréhension, des pistes concrètes pour la pratique quotidienne, mais aussi des repères pour penser une médecine plus ouverte, plus intégrative et résolument tournée vers l’avenir.

Bonne lecture à toutes et à tous !

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